Año 3084. Tras décadas de enfrentamientos, el señor de la guerra Daigo Kagemitsu (Nichi Nakai) llega a un pacto con los demonios: éstos le concederán el poder para conquistar el mundo, a cambio del cuerpo de su hijo. Veinte años después, una ladrona llamada Dororo (Kou Shibasaki) conoce a un misterioso jove, Hyakkimaru (Satoshi Tsumabuki), quien viaja para recuperar las partes de su cuerpo que le fueron robadas de niño. Juntos se embarcarán en una aventura fantástica con un objetivo comúm: La venganza.
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